Tafsir ilmi atau penafsiran al Qur'an dengan pendekatan ilmiah, merupakan salah satu bentuk tafsir yang digunakan untuk memamhami ayat-ayat kauniyah. Ayat-ayat kosmologi baik yang tertulis dalam kitab suci maupun yang terbentang di alam raya.
Penafsiran ilmiah terhadap ayat-ayat sains dalam al Qur'an dimungkinkan karena al Qur'an tidak hanya mengandung ilmu agama, tetapi juga ilmu-ilmu umum termasuk ilmu alam, sebagai cikal bakal sains dan teknologi.
Tafsir perspektif sains memungkinkan al Qur'an selalu hadir di tengah-tengah masyarakat pada setiap zaman dan ruang, kapanpun dan dimanapun.
Tafsir ilmi adalah sebuah upaya memahami ayat-ayat al Qur'an yang mengandung isyarat ilmiah dari perspektif ilmu pengetahuan modern. Menurut Husain az-Zahabiy, tafsir ilmi membahas istilah-istilah ilmu pengetahuan dalam penuturan ayat-ayat al Qur'an, serta berusaha menggali dimensi keilmuan dan menyingkap rahasia kemukjizatannya terkait informasi-informasi sains yang mungkin belum dikenal manusia pada masa turunnya sehingga menjadi bukti kebenaran bahwa al Qur'an bukan karangan manusia. Namun wahyu sang Pencipta dan pemilik alam raya.
Pembahasan buku ini mencakup bab 1 Pendahuluan; bab 2 Manusia sebagai makhluk jasmani-rohani; bab 3 membahas Term-term tentang jiwa dalam al Qur'an seperti Nafs, Qalb dan Ruh; bab 4 Jiwa dalam pandangan filsuf muslim dan kaum sufi seperti Ibnu Sina, Ibnu Arabiy, al-Ghazali, Ibnu TaImiyyah, al-Junaid al Bagdadiy, al-Hallaj, Ibnu 'Ata'illah, as-Sakandariy, Ibnu Qayyim al-Jauziyyah, Syekh Abdul Muhyi Pamijahan, Rashid Ridha, Ahmad Mustafa al-Maragiy, Sayyid Qutb, Wahbah az-Zuhaili dan Mulla Huwaisy; bab 5 Gejala kejiwaan pada manusia normal yang meliputi Sensori dan Persepsi, Berfikir dan Memori, Emosi dan Motivasi; bab 6 membahas Gangguan kejiwaan seperti Psikopat, Kecemasan dan Fobia, Hipokrit / Munafik, Antisosial dan Macam-macam penyimpangan Seksual; bab 7 menjelaskan Fenomena Kejiwaan dan Kesehatan; bab 8 Fenomena Kesurupan dan Mimpi; pembahasan diakhiri pada bab 9 Penutup.